El Instituto Mariano Pachecoy comenzó a funcionar el 2 de Julio de 1990, en la ciudad de Puerto Iguazú, Misiones. En principio era sólo de Nivel Inicial y se denominaba "El Pato Lucas".

Su propietaria, Sra. Ana del Pilar González Pereira, una apasionada de la educación y la innovación metodológica, siempre buscó estar a la vanguardia en todos los niveles educativos. 

En el año 2010, el 2 de Julio, el Jardín de Infantes "El Pato Lucas" se convierte en Instituto de Nivel Inicial "Mariano Pachecoy". El cambio de nombre se debió al homenaje que se le hiciera al alumno Mariano Wenceslao Pachecoy, que falleciera el 11 de Abril del mismo año. Mariano era un niño ejemplar, a pesar de las limitaciones que le provocaba la hidrocefalia, demostró tener el carisma, las ganas y el compromiso de aprender. Lamentablemente, partió demasiado pronto.

En el año 2012 se transformó en Instituto de Educación Técnica con la Carrera de Técnico Superior en Administración Pública; con el correr de los años se sumaron la carrera de Técnico Superior en gestión Contable e Impositiva; La Formación Docente en Marketing y en Recursos Humanos para empresas de Servicio.

En el año 2015, la Sra Ana González Pereira, funda  FunSaMI - Fundación Santa María del Iguazú - y la Institución cambia de titular con esa entidad.

A partir de allí se le suman los Profesorados de TIC, Matemática y Música, transformándose también en Instituto Superior de Formación Docente.